フレックスタイム制を導入したいのに勤怠管理が追いつかない訳とは・・・・
2025年12月25日
フレックスタイム制を導入したいと考えても、実際には「勤怠管理の正確さ」が壁になる企業が多くあります。特に中小企業では「どの時間を労働時間としてカウントすべきか」が曖昧になり、結果的に残業代計算や労働時間の把握でトラブルが発生するケースがあります。
労働時間を自己申告に任せると、記録の抜け漏れや不正確な申告が起きやすく、せっかくの柔軟な働き方が逆に「リスクの温床」になることもあります。

1.放置すれば法令違反リスクが高まる勤怠の落とし穴
勤怠管理を曖昧なままにしておくと、次のような問題が起こりやすくなります。
・清算期間の総労働時間が把握できず、時間外労働の未払いが発生
・固定残業代とフレックスタイムの超過時間の関係が不明確
・労基署から「労働時間の管理不備」として是正勧告を受けるリスク
・従業員から「残業代の未払い」が訴えられることで関係が悪化
実際、厚生労働省の調査では、フレックスタイム制を導入している企業のうち約42%が「勤怠集計の運用に課題を感じている」と回答しています。
https://www.mhlw.go.jp/content/11201250/001462595.pdf
制度そのものは魅力的でも、「運用を誤れば企業の信頼を損ねる」のです。
2.Saas勤怠管理システムでフレックス導入をスムーズに
Saas勤怠管理システムは、フレックスタイム制を正確かつ簡単に運用できるソリューションです。
日々の打刻データを自動集計し、清算期間ごとの総労働時間をリアルタイムに可視化。
固定残業代制度にも対応しており、法令基準に沿った時間外・深夜・休日労働の自動計算を行います。
さらに、労働時間の上限規制までをカバーするため、担当者の手間を大幅に削減できます。
3.導入で得られる3つの効果
フレックスタイム制を導入することで、働き方改革を推進する企業が増えています。
「SaaS型勤怠管理システム」を導入すると、以下のような効果が期待できます。
・勤怠の記録ミスや集計エラーが減少し、労務リスクが軽減
・柔軟な働き方の実現で従業員満足度が向上
・人事担当者の集計作業が自動化され、月20時間以上の工数削減
中でも「固定残業代とフレックスの併用設計」に可能で複雑な勤務体系でも「正確に・自動で・法的に安全に」運用できます。
4.よくある質問
Q: フレックスタイム制と固定残業代は併用できますか?
A: はい、可能です。ただし固定残業時間を超過した場合の精算方法を明確に設計する必要があります。
Q: 清算期間はどのくらいの期間が一般的ですか?
A: 最長3か月まで設定できます。1か月単位での運用が最も多く、制度運用の安定化にも向いています。
Q: 勤怠データを給与計算ソフトに連携できますか?
A: 主要給与システムとAPI連携が可能です。CSV出力にも対応していますので、既存環境に合わせたスムーズな移行ができます。
Q: 労基署対応のための帳票出力はできますか?
A: はい、日別・月別・清算期間別の労働時間台帳を出力できます。
法令変更にも自動アップデートで対応します。
Q: 導入にかかる期間はどのくらいですか?
A: 一般的には平均2〜4週間で本稼働が可能です。
今すぐ始めるためのステップ
フレックスタイム制は、制度自体よりも「運用の正確さ」が成功のカギです。
勤怠管理を自動化し、固定残業代との整合性を確保すれば、安心して柔軟な働き方を実現できます。
まずは無料診断で、自社の勤怠管理リスクをチェックしてみましょう。
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